Pečoras klimats ir mēreni kontinentāls ar ilgu un mēreni bargu ziemu un īsu, siltu vasaru ar nelielu karsto dienu skaitu. Gada vidējā gaisa temperatūra ir -2,5 °C. Janvāra temperatūra ir -19,3 °C (absolūtais minimums -56 °C), bet jūlija +15,4 °C (absolūtais maksimums +35 °C). Sniega sega izveidojas ap 26. oktobri, bet izkūst 10. maijā (tā noturas 192 dienas). Bezsala periods ilgst 70 dienas, bet veģetācijas periods - 73 dienas. Aktīvo temperatūru (virs 10 °C) summa ir ap 1100 °C. Gada nokrišņu daudzums ir ap 580 mm. Pečorā baltās naktis vasarā ir 79 dienas no 12 maija līdz 30. jūlijam. Vidējais vēja ātrums - 3,7 m/s. Gaisa mitrums: 77%.