Neraugoties uz malajiešu un indonēziešu valodas līdzību, Vikipēdijas malajiešu un indonēziešu valodas sadaļas sāka veidot divas dažādas autoru grupas. Indonēziešu Vikipēdija tika izveidota aptuveni sešus mēnešus pēc malajiešu Vikipēdijas izveides. Kopš 2009. gada Indonēzijas Vikipēdijā bija trīs reizes vairāk aktīvo redaktoru un rakstu nekā malajiešu Vikipēdijā.