Klubs tika nodibināts 1998. gada 29. aprīlī, apvienojoties diviem pilsētas klubiem — Cercle Football Dijonnais un Dijon FC. 1999.–2000. gada sezonā uzvarēja Francijas amatieru čempionātā (Francijas futbola 4. līmenis) un tika paaugstināts uz Francijas Nacionālo līgu. 2003.–2004. gada sezonā iekļuva Francijas kausa izcīņas pusfinālā, kā arī ieguva 3. vietu Nacionālajā līgā un tika paaugstināts uz 2. līgu. Tajā pašā gadā kļuva par profesionālu klubu.[2]
2010.–2011. gada sezonā komanda izcīnīja 3. vietu Francijas futbola 2. līgā un pirmoreiz kluba vēsturē iekļuva Francijas futbola augstākajā līmenī — 1. līgā (Ligue 1). Klubam neizdevās nostiprināties elites divīzijā, tas ierindojās tikai 19. vietā un bija spiests atstāt Ligue 1. 2016. gadā klubam izdevās atkal izcīnīt ceļazīmi uz Francijas 1. līgu.
.svg){kind=small}
Dižona, Francija
Vikikrātuvē par šo tēmu ir pieejami multivides faili. Skatīt: Dijon FCO.
