Jāņa Kažociņa tēvs Indulis bijis latviešu virsnieks Latvju jaunatnes organizācijā, kas pildīja latviešu zēnu aprūpes virsnieka pienākumus vācu gaisa spēku palīgdienestā vācu okupācijas laikā.[1]
2003. gadā Kažociņš kļuva par Latvijas pilsoni.[3] No 2003. līdz 2013. gadam vadījis Satversmes aizsardzības biroju. Pēc amata atstāšanas 2013. gadā kļuva par Aizsardzības ministra un Ārlietu ministrijas ārštata padomnieku. Pēc tam bija Valsts prezidenta ārštata padomnieks sabiedrības integrācijas jautājumos (2015—2016). No 2016. gada — Valsts prezidenta nacionālās drošības padomnieks, Nacionālās drošības padomes sekretārs.[4]