Pirmā nocietinātā apmetne netālu no mūsdienu Sļudjankas izveidota 1647. gadā Kultukā 11 km attālumā. Tikai 1802. gadā šeit parādījās nozīmīgāka apdzīvotā vieta, saistīta ar Apkārtbaikāla traktu. 1899. gadā, uzsākot Apkārtbaikāla dzelzceļa būvniecību, tika izveidots Sļudjankas dzelzceļnieku ciemats (no 1928. gada strādnieku ciemats, no 1936. gada — pilsēta).