Mūsdienu Jaunjelgavas pagasta teritorija vēsturiski ietilpa Jaunjelgavas pilsētas sastāvā.[nepieciešama atsauce] 1957. gada 7. janvāri tika izveidota Jaunjelgavas lauku teritorija,[4] kurā iekļāva Sērenes ciemu un no Jaunjelgavas pilsētas atdalīto skraji apbūvēto dienviddaļu.[nepieciešama atsauce] 1992. gada 2. aprīlī Jaunjelgavas lauku teritoriju reorganizēja par Sērenes pagastu,[5] bet 1996. gada 29. maijā Jaunjelgavai pievienoja daļu Sērenes pagasta teritorijas kā Jaunjelgavas pilsētas lauku teritoriju.[6] 2010. gadā Jaunjelgavas lauku teritoriju pārdēvēja par Jaunjelgavas pagastu.