Vologdas klimats ir mēreni kontinentāls. Ziema ilga, bet maiga, ilgst piecus mēnešus. Janvāra vidējā gaisa temperatūra ir -11 °C, bet jūlija +17 °C. Gada vidējā temperatūra +2,8 °C. Pavasaris un rudens ir vēsi. Arī vasara samērā vēsa. Nokrišņi visvairāk izkrīt vasarā, bet to daudzums gada laikā ir 570 mm. Gaisa mitrums ir 80%. Vidējais vēja ātrums: 3,5 m/s.